Le variant C.1.2 détecté pour la première fois en Afrique du Sud a le plus muté par rapport au virus d’origine que tout autre variant connu.
Une nouvelle variante du coronavirus, C.1.2, a été détectée en Afrique du Sud et dans un certain nombre d’autres pays, craignant qu’il ne soit plus infectieux et qu’il échappe aux vaccins, selon une nouvelle étude de préimpression de l’Institut national sud-africain des maladies transmissibles et du Plateforme d’innovation et de séquençage de la recherche KwaZulu-Natal. L’étude est en attente d’examen par les pairs.
Les scientifiques ont détecté pour la première fois le C.1.2 en mai 2021, constatant qu’il descendait de C.1, ce que les scientifiques ont trouvé surprenant car C.1 avait été détecté pour la dernière fois en janvier. La nouvelle variante a «considérablement muté» par rapport à C.1 et est plus éloignée du virus d’origine détecté à Wuhan que tout autre variante préoccupante (VOC) ou variante d’intérêt (VOI) détectée jusqu’à présent dans le monde.
Détecté pour la première fois en Afrique du Sud, C.1.2 a depuis été trouvé en Angleterre, en Chine, en République démocratique du Congo, à l’île Maurice, en Nouvelle-Zélande, au Portugal et en Suisse.
Les scientifiques pensent que le nombre de séquences disponibles de C.1.2 peut être une sous-représentation de la propagation et de la fréquence du variant en Afrique du Sud et dans le monde. L’étude a révélé des augmentations constantes du nombre de génomes C.1.2 en Afrique du Sud sur une base mensuelle, passant de 0,2% des génomes séquencés en mai à 1,6% en juin, puis à 2% en juillet, similaire aux augmentations observées avec le Il existe des variantes bêta et delta.
L’étude a également révélé que la lignée C.1.2 a un taux de mutation d’environ 41,8 mutations par an, ce qui est presque deux fois plus rapide que le taux de mutation global actuel des autres variantes. Les scientifiques ont déclaré que cette courte période d’évolution accrue a également été observée avec les variantes Alpha, Beta et Gamma, suggérant qu’un seul événement, suivi d’un pic de cas, a entraîné des taux de mutation plus rapides.
Plus de la moitié des séquences C.1.2 ont 14 mutations, mais des mutations supplémen-taires ont été remarquées dans certaines des séquences, suggérant que l’évolution au sein de la lignée est en cours, selon l’étude.
Plus de la moitié (environ 52 %) des mutations dans la région de pointe des séquences C.1.2 ont déjà été observées dans d’autres COV et VOI. Les mutations N440K et Y449H, qui ont été associées à la fuite de certains anticorps, ont également été remarquées dans les séquences C.1.2. Les scientifiques ont souligné que la combinaison de ces mutations, ainsi que des changements dans d’autres parties du virus, aident probablement le virus à échapper aux anticorps et aux réponses immunitaires, y compris chez les patients qui ont déjà été infectés par les variantes Alpha ou Beta.
Les scientifiques ont ajouté que des travaux supplémentaires sont nécessaires pour comprendre l’impact exact de ces mutations et pour voir si elles donnent à la variante un avantage concurrentiel sur la variante Delta.
L’étude intervient alors qu’un médecin en Turquie a signalé des indications selon lesquelles une nouvelle variante de coronavirus avait été détectée dans le pays, avec des tests détectant des mutations qui n’ont pas été trouvées dans les variantes actuelles nommées par l’Organisation mondiale de la santé (OMS).
Le Dr Lütfi Çamlı a déclaré aux médias turcs que bien que des tests aient été effectués pour détecter la présence de variantes en Turquie, les médecins ont trouvé une nouvelle variante sans lien avec les autres variantes, atteignant un taux d’environ 50 à 60 % des cas dans la province du nord de Rize. Çamlı a souligné, cependant, qu’il n’est toujours pas clair s’ils ont réellement trouvé une nouvelle variante ou s’il s’agissait simplement du résultat d’une fausse négativité dans les tests PCR.
Le médecin a en outre souligné qu’il était normal que de nouvelles mutations apparaissent lors d’une épidémie et que les mutations récemment découvertes en Turquie pourraient ne pas avoir d’effet sérieux sur le fonctionnement du virus. Çamlı a appelé à des recherches plus poussées et à ce que les résultats des tests génomiques des échantillons effectués à Ankara soient rendus publics.
Mercredi dernier, l’OMS avait identifié quatre COV et quatre VOI. Jeudi dernier, le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC) en avait identifié cinq et six respectivement. Un certain nombre d’autres variantes ont été désignées pour une surveillance plus poussée.
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